《農業環境科學學報》曾用名為《農業環境保護》，創刊于1981，于2003年改為現刊名。是由農業部主管,農業部環境保護科研監測所和中國農業生態環境保護協會聯合主辦的全國性學術類科技期刊，該刊是國內惟一報道農業環境學科領域最新研究及其進展的學術期刊，其指導思想是充分發揮它在國內農業環境科學領域的導向性、權威性和科學性，逐步擴大期刊在國外的影響力。獲獎情況：全國中文核心期刊；列于被引頻比最高的中國科技期刊500名之內。

《農業環境科學學報》主要刊登農業生態環境科學領域內具有創新性的研究成果，包括新理論、新技術和新方法。報道領域包括農業污染控制與治理、生態農業、環境修復技術與原理、環境毒理與風險評價、環境監測與評價、廢棄物綜合利用等。近年來，隨著我國農業環境科學事業的蓬勃發展，刊物也取得了長足的進步，無論是在科技期刊領域，還是在農業環境科學研究領域，都得到了專家的高度評價和贊賞。