《河北工程大學學報(自然科學版)》創刊于1984年，當時刊名為《河北煤炭建筑工程學院學報》。1991年經國家科委和新聞出版署批準成為公開發行刊物，國內統一刊號為: CN13-1140/TD。1996年ISDS 中國國家中心頒發國際標準刊號：ISSN 1004-5317；1997年正式更名為《河北建筑科技學院學報》，國際標準刊號：ISSN1007－6743，國內統一刊號為：CN13-1218/TD。1998美國國際CODEN中心分配了國際刊名代碼CODEN:HJKXFS，并正式成為科技部中國科技論文統計源期刊，同年成為中國學術期刊（光盤版）全文收錄期刊。1999年被美國化學文摘－chemical abstract（CA）收錄。

《河北工程大學學報(自然科學版)》2000年成為中國科學引文數據庫源刊、中國學術期刊綜合評價數據庫源刊。2001年被萬方數據庫全文收錄。2001年9月全文被《中文科技期刊數據庫》收錄。2003年1月被《中國核心期刊（遴選）數據庫》收錄，同時被中國學術期刊（光盤版）電子雜志社評為第三批執行《CAJ-CD規范》優秀期刊，同年3月被俄羅斯《文摘雜志》（PЖ）確定為定期收錄期刊。2006年8月經新聞出版總署批準，更名為《河北工程大學學報(自然科學版)》，國內統一刊號為：CN13-1375/N。辦刊宗旨：堅持馬列主義、毛澤東思想、 鄧小平理論和“三個代表”重要思想，全面貫徹科學發展觀；為高校教育工作者和科技工作者提供理論陣地，為促進自然科學的發展和我校自然科學學科的建設服務。獲獎情況：中國學術期刊綜合評價數據來源期刊、中國科學論文統計源期刊。