《南方醫科大學學報》（月刊）創刊于1981年，由南方醫科大學主辦。為國內外發行的高級綜合性醫藥衛生期刊。

《南方醫科大學學報》經過不斷努力，本刊已成為國內外作者發表有較高學術水平的生物醫學論文的園地，現已被美國Medline/PubMed、美國化學文摘(CA)、中國科技論文索引數據庫、中文核心期刊要目總覽（2008版，北京大學圖書館）等國內外重要數據庫收錄。對經評審具有新穎性、創造性的基礎研究論文及具有較大臨床應用價值的論文，本刊將實行優先數字出版及紙質出版（發表周期1~3月）。對于境內外有較高學術水平的英文論文，本刊將在2個月內發表并減免部分費用。

《南方醫科大學學報》被北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊，國立醫學圖書館生物醫學檢索系統收錄。是中國綜合性醫藥衛生類核心期刊。