《南京中醫(yī)藥大學學報》（雙月刊）創(chuàng)刊于1959年創(chuàng)刊，是由南京中醫(yī)藥大學主辦的全國有影響的綜合性中醫(yī)藥學術(shù)刊物。

《南京中醫(yī)藥大學學報》設(shè)有學術(shù)探討、臨床研究、方藥研究、針灸推拿、醫(yī)史文獻臨床報道、經(jīng)驗交流等專欄。

《南京中醫(yī)藥大學學報》是國際標準連續(xù)出版物，被北大2008版核心期刊收錄。