《南京工業大學學報（自然科學版）》（雙月刊）創刊于1979年，是由南京工業大學主辦的學術刊物。

《南京工業大學學報（自然科學版）》本刊編委由國內一流化工、材料、生工、化機、土木等方面專家組成，他們不但積極為本刊撰稿、審稿，還積極向同行專家約稿、組稿，從而得證了本刊的學術水平。本刊被英國CA，劍橋文摘，俄羅斯文摘，中國化學化工文摘，中國生物學文摘，中國無機分析化學文摘等收錄，德國漢諾威大學圖書館，我國國家圖書館以及有關高校、研究所大型企業均訂購我學報。獲獎情況：中國期刊方陣雙效期刊；中國高校優秀科技期刊獎；江蘇省優秀期刊；中國高校科技期刊研究會優秀網站；1995年獲全國高校自然科學優秀學報一等獎；曾兩屆榮獲江蘇省十佳期刊。