《昆明理工大學學報（自然科學版）》（雙月刊）本刊1959年創刊，屬不定期刊物，1988年經中共云南省委宣傳部及云南省新聞出版局批準向國外公開發行，雙月刊，1995年經國家科委批準，因主辦單位由昆明工學院改名為昆明理工大學，該學報也由昆明工學院學報更名為昆明理工大學學報。主要刊登地質、礦業工程、冶金材料、自控計算機、建筑、環境化工、汽車工程、經濟管理、數理化、力學等學科有創見的學術論文、科研報告。

主要設有“有色金屬冶金科學與技術”，“材料科學與工程”，“地學與礦業工程”，"建筑工程與交通運輸"，“機械、電子信息與自動控制”，“能源與動力科學”，“生命科學與醫學”，“環境科學、化學與化學工程”，“管理科學與工程”“數學與力學”10個欄目。

《昆明理工大學學報（自然科學版）》2006年榮獲云南省"優秀期刊提名獎"； 2007年榮獲云南省2006-2007年度"高校優秀學報編輯部"稱號； 2009年榮獲云南省"優秀期刊獎"； 2009年常務副主編潘光友編審榮獲"優秀主編獎"和"突出貢獻獎"，專職編輯朱銀周副編審榮獲"優秀編輯獎"。