《第三軍醫大學學報》（半月刊）創刊于1979年，由第三軍醫大學主管、主辦，國內外公開發行的綜合性醫藥衛生類學術刊物。

《第三軍醫大學學報》主要欄目設有：專家論壇、論著（軍事醫學、基礎醫學、臨床醫學、藥學、預防醫學、檢驗醫學、生物醫學工程等）、技術方法、研究快報、短篇論著、經驗交流、疑難病例、個案與短篇和學術之窗。創刊至今，堅持正確的辦刊宗旨，以質量特色求生存，以社會效益求發展，在傳播新理論、交流新經驗、推廣新技術、普及新知識等方面作出了積極貢獻。

《第三軍醫大學學報》被北大1992版核心期刊、北大1996版核心期刊、北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊收錄。先后20余次獲全國、全軍、教育部和省、市優秀科技期刊一、二等獎，2004年獲全國高校學報一等獎。