《南京大學學報（自然科學）》創刊于1955年1月，是南京大學主辦、國家教委主管、國家科委審批的中央級自然科學綜合性學術刊物，現為雙月刊，國內外公開發行。獲獎情況：中國自然科學核心期刊；中國期刊方陣“雙效”期刊。

《南京大學學報（自然科學）》其報道內容包括數學、天文、計算機科學、物理、信息物理、化學、生物、生物化學、地球科學、大地海洋學、大氣科學、環境科學、醫學等學科的基礎研究和應用研究。固定收錄《南京大學學報（自然科學）》的國外權威性數據庫和文獻雜志在4個以上，例如俄羅斯文摘雜志（PЖ）、美國數學評論（MR）、化學文摘（CA）和德國數學文摘（ZM）等。