《東南大學學報(自然科學版)》是東南大學主辦的。

《東南大學學報(自然科學版)》以機械動力、能源環境、材料科學、電力電氣、通信工程、電子工程、計算機工程、自動控制、儀器科學、土木交通和生物醫學等專業學科為主的學術期刊。被美國《工程索引》(EiCompendex)、英國《科學文摘》、中國科學引文數據庫(CSCD)、《中文核心期刊要目總覽》、中國科技論文統計源期刊等數據庫收錄。

《東南大學學報(自然科學版)》先后榮獲第三屆國家期刊獎百種重點期刊獎，首屆、第二屆和第三屆中國高校精品科技期刊獎，首屆、第二屆和第三屆中國科技論文在線優秀期刊一等獎等，2013年榮獲首屆江蘇省新聞出版政府獎"報刊獎"，1996年教育部優秀科技期刊一等獎、1997年第二屆全國又秀科技期刊評比二等獎、1999年中國高校自然科學學報系統優秀學報評比二等獎。2008年被中國科技信息研究所評為百種中國杰出學術期刊，2008年和2011年被中國科技信息研究所評為中國精品科技期刊。2009年和2011年被武漢大學中國科學評價研究中心評為RCCSE中國權威學術期刊，2012年入選“2012中國最具國際影響力學術期刊”，2013年獲首屆江蘇省新聞出版政府獎“報刊獎”。被美國《工程索引》(EiCompendex)、英國《科學文摘》等7家國際重要數據庫收錄。2010年榮獲第三屆中國高校優秀科技期刊獎。