《北京生物醫學工程》（雙月刊）創刊于1981年，由北京生物醫學工程學會；北京市心肺血管疾病研究所主辦。

《北京生物醫學工程》是綜合性學術刊物，主要刊登人工器官、生物材料、生物力學、生物信息與控制、生物醫學測量、醫藥工程、生物工程、中醫工程、計算機在生物醫學中的應用、醫療器械等方面的理論研究與最新科技成果。設有論著、綜述、研究簡訊、臨床應用、交流與討論、儀器維修、專家論壇和科學管理等欄目，適合中高級從事生物醫學工程的科研人員、工程人員、臨床醫護人員的閱讀。本刊是中國核心期刊數據庫收錄期刊、中國科技論文統計源期刊、中國學術期刊（光盤版）、中國期刊網入編期刊、中國學術期刊綜合評價數據庫來源期刊、中文生物醫學期刊文獻數據庫收錄期刊、中國醫學文摘數據庫收錄期刊。

《北京生物醫學工程》被北大1992版核心期刊收錄。