《贛南醫學院學報》是由贛南醫學院主辦，國內外公開發行的醫學綜合性學術期刊。創刊于1980年，刊名為《贛南醫專學報》，內部資料，不定期出版，1987年12月經新聞出版總署批準，改為半年刊，公開發行，1989年改為《贛南醫學院學報》季刊，2002年改為雙月刊，大16開，逢雙月底出版，國內統一刊號CN：36-1154/R，國際標準刊號ISSN：1001-5779。

《贛南醫學院學報》自創刊以來，以堅持黨的四項基本原則，貫徹黨和國家的教育、科技、衛生工作方針，繁榮學術研究為宗旨，嚴格遵守有關法令、法規和條例，面向經濟建設，及時反映、交流和推廣我校及國內外醫學科研及教育的新成果、新技術、新經驗，促進醫療衛生事業的發展。

《贛南醫學院學報》為《中國學術期刊（光盤版）》、《中國期刊網》《萬方數據庫-數字化期刊群》、《中文科技期刊數據庫》全文收錄期刊，為《中國學術期刊評價數據庫》來源期刊。《贛南醫學院學報》1997年獲第二屆江西省優秀科技期刊先進科技期刊獎，2003年獲首屆《CAJ-CD規范》執行優秀期刊獎，2008年獲第三屆江西省優秀期刊版式設計獎，2009年獲全國高校科技期刊優秀編輯質量獎。