《南方水產科學》是由中國水產科學研究院南海水產研究所主辦，國內外公開發行的學術類水產科技期刊。創刊于2005年（原名：南方水產）。

《南方水產科學》主要報道漁業資源、捕撈技術、漁業設施、漁業環境保護、水產養殖與增殖、漁業生物病害、水產品加工與綜合利用以及水產基礎研究等方面的論文、研究簡報、綜述等。2008年入選中國科技論文統計源期刊（中國科技核心期刊），2011年入選RCCSE中國核心學術期刊以及《中文核心期刊要目總覽》2011年版，2013年入選中國科學引文數據庫（CSCD），2009年以來先后被美國《化學文摘》（CA）、美國劍橋文摘（自然科學版）（CSA）、英國《動物學記錄》（ZR）、英國《食品科技文摘》（FSTA）、英國《國際農業與生物科學研究中心》（CABI）、俄羅斯《文摘雜志》和波蘭《哥白尼索引》（IC）等7種國際重要檢索系統收錄。《南方水產科學》立足南方，面向全國，突出學術性、地域性、實用性和可讀性，重點報道國內外漁業科研、生產的新技術、新成果及新動向。獲獎情況：獲廣東省優秀科技期刊三等獎。